Bonjour et bienvenue.
Tes questions sont légitimes, tout le monde se les pose en début de réflexion végétarienne. Mais les réponses sont malgré tout assez simples.
Certains animaux mangent d'autres animaux, mais tous les animaux ne mangent pas d'autres animaux. Et la plupart des animaux qui mangent d'autres animaux le font pour survivre. Tandis que d'autres mangent des animaux parce qu'ils ne se posent tout simplement pas la question.
Les humains ont l'immense privilège de pouvoir se poser la question, de pouvoir vivre sans manger d'animaux, donc d'avoir le choix. Le choix de ne pas faire de mal inutilement, de ne pas rajouter de l'injustice et de la souffrance au monde.
Pour faire nos choix moraux, on n'a pas besoin de prendre l'exemple des autres, que ça soit les animaux non-humains, ou même les animaux humains. D'autres humains commettent des crimes, ou causent à autrui des souffrances inutiles (aussi à des humains), mais je sais néanmoins que ce sont des souffrances inutiles, et je fais le choix, moi, de ne pas les infliger à autrui.
"Les animaux se tuent entre eux (donc je peux manger des animaux)", c'est à peu de choses près la même phrase que "Les gens se tuent entre eux (donc je peux tuer des gens)". Et pourtant, c'est bien la vérité : Les gens se tuent entre eux.
Les amalgames abstraits que sont "les animaux", "la nature" ont historiquement servi à défendre beaucoup de choses immorales, mais on a toujours su faire évoluer la société pour la rendre plus morale, vers plus d'égalité envers tous les individus. (La Déclaration des Droits de l'Homme n'a que 200 ans, par exemple. En France, le droit des vote des femmes n'a que 70 ans.). Et bien sûr, on ne prend pas exemple sur "les animaux", "la nature" pour tout un tas d'autres choses (technologie, médecine, justice, sciences, divertissement, confort, etc.). "Les animaux", "la nature" qui viennent spontanément à l'esprit (parce qu'on nous l'a appris), nous servent surtout à détourner l'attention de ce choix moral qui est notre entière responsabilité.
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Quant au végétalisme déconseillé dans certaines conditions, c'est simplement que le discours médical Français d'aujourd'hui est adapté à un certain contexte social et économique (Sans même parler des interactions inévitables qui existent entre les différentes institutions, les lobbies, etc. Il y a des conflits d'intérêts partout.).
Changer son régime, ça nécessité une adaptation, donc d'acquérir quelques connaissances en diététique (pas bien compliquées, mais qu'il faut quand même acquérir) pour que ce changement se passe au mieux. Dans les pays nordiques et anglosaxons où le végétarisme est déjà plus développé, le discours officiel, les recommandations officielles pour les végétariens et végétaliens sont bien plus développées. Et au lieu, comme en France, de se contenter d'un "VOUS NE POUVEZ PAS ETRE VEGETALIEN ! C'EST BEAUCOUP TROP DANGEREUX !" parce que les plupart des médecins n'ont pas les connaissances diététiques nécessaires (Parce que, d'un point de vue santé publique, dans une société où les végés sont peu nombreux, il n'est pas nécessaire de prendre leur cas au sérieux : Pour réduire le problème, il suffit de leur faire peur pour en diminuer le nombre.)... on aura à la place aux USA, au Canada, au Royaume Uni, des choses comme "Si vous voulez passer au végétarisme, qui est un choix sain, vous devez connaître telle chose et telle chose, et telle chose. Et les médecins pourront vous y aider. Si vous voulez passer au végétalisme, qui est également un choix sain, vous devez également savoir, en plus, ceci et cela.". Ce qui est à la fois bien plus honnête, et bien plus prudent.
Voilà quelques liens :
http://www.dietethics.eu/fr/nutrition/r ... me-uni.php
http://www.alimentation-responsable.com ... n-ADA-2009
http://www.vegetarisme.fr/vegetarien.ph ... rien_sante